出現於上述婦女的卵巢囊腫絕大部分都屬良性，當中又分為生理性水泡或病理性囊腫。

生理性水泡（如濾泡性囊腫和黃體性囊腫等）佔所有卵巢囊腫個案的八成。大多數生理性水泡會隨着月經周期自然消失，一般可於一至兩個月後再作超聲波覆查。而常見的病理卵巢囊腫包括子宮內膜異位囊腫（又稱朱古力瘤）、畸胎瘤和囊腺瘤。

除了子宮內膜異位或會影響卵巢和輸卵管的功能外，大部分卵巢囊腫本身不會引致不育。若患者出現卵巢囊腫大於五厘米、疼痛或腹脹等徵狀，甚至懷疑是惡性的話，就需要考慮接受切除手術，隨後將囊腫送作病理化驗，以避免引致卵巢囊腫出血、感染或扭轉等併發症。在大部分情況下，可採用腹腔鏡手術將囊腫切除，手術過程中應盡量避免損害正常的卵巢組織，以免因影響卵巢儲備而降低日後的受孕機會，甚至引致提早進入更年期。